金刚（许冠杰 饰）与光头佬（麦嘉 饰）在一次泰国的任务中不欢而散，自此分道扬镳各奔前程……时间一晃三年，国宝兵马俑与秦皇宝剑在赴港展出的路上被白手套一伙施调包计窃走，自称“新最佳拍档”的飞贼姐弟（利智&张国荣 饰）再由白手套手中夺走宝剑，并高调登报嫁祸于最佳拍档。一时间，大陆方面派出的中国蓝波（李元霸 饰）与白手套等人均认为退出江湖的最佳拍档是夺剑人，对金刚和光头佬展开连番追捕。最终两个老搭档终于澄清误会，联合飞贼姐弟接受大陆方面的艰苦训练，以期能够为保护国宝而战……　　本片是《最佳拍档》系列电影的第五集。

　　舞狮在南方武馆非常流行，并自有其规矩，如果在舞狮中逾矩，则很容易引起武馆之间的争执。郑天寿武馆因舞狮遭到挑衅与陆正甫武馆结怨，另一武馆主黄麒英（谷峰 饰）与儿子黄飞鸿（刘家辉 饰）出面调停，却未起作用。黄飞鸿与郑氏武馆的王隐林（麦德罗 饰）互为好友，二人约定与第三方较量以便分出彼此武功高下，岂料王隐林之妹菊英（惠英红 饰）匆忙中造成误会，导致王隐林受伤，菊英又二话不说向洪飞鸿寻仇……这边的误会刚解除，陆正甫武馆的公子陆山豪用计将王隐林重伤，而陆正甫将之前打伤王隐林的精武门高手单雄（王龙威 饰）迎入武馆，图谋利用单雄的北派功夫打击黄麒英、郑天寿等武馆同行。此时黄飞鸿向陆正甫讨要说法，未知吉凶如何……

　　号称“乾坤双雄”的余干文与郑乾元，奉师父独臂道长之命，下山寻访“天地剑”以免武林浩刼，两人下山余干文遇见五毒教主之女苏皎皎。皎皎对干文颇有好感——郑坤元在古墓为皎皎所伤，当皎皎得知坤元是干文师弟，后悔不已——关天勇指干文是杀禹门镖局三十口人的凶手，皎皎赶到，自承是凶手，忽然邓九仞出现，手持天地剑，照武也持天地剑，一天一地两剑相交，皆断，剑心内显出,巨祸消解。

　　清朝末年，义和团神打之术一时兴盛，曾入宫表演，得西太后奖赏。　　转眼已是民国，小徒弟萧千（汪禹 饰）随师父以神打术行走江湖，一日师父大醉，萧千被众人拖去请神。萧千神功虽无，武功确有，一番猴拳加道具的表演蒙混了观众，却得罪了观法的拳师，被追打出镇。　　萧千迤逦来到一小镇，由于用神打术替小乞儿出头，开始在镇上崭露头角。路见不平的性格让他惹事无数，也拜此所赐结识伶俐姑娘金莲（林珍奇 饰）。一对儿心思纯洁、胸怀正义的搭档自此为镇上“人鬼两界”的难题奔忙。当然，萧千也不会放弃助人期间任何一次可以填饱肚子的机会……

林益当年差多年，仍是散仔一名，心有不甘，时欲“发围”。此时林的外甥水牛从美国回来渡假，因帮助在酒吧邂逅的席梦思。因而令林、思及自己卷入一宗侵吞军火交易的罪行之中……