《忍者龟》新系列的故事发生在纽约曼哈顿，在热闹的市区的地下水道里，生活着主人公：四只少年忍者龟和一只六英尺高的老鼠——他们的老师斯普林特。　　某一天，作为人类的斯普林特不幸遭受了一种神奇绿色物质的辐射，变异成了一只老鼠，而他随身携带的四只宠物龟也开始发生了变化......

　　五个退伍老兵，贝斯特、尼克、罗科、杰克与充气娃娃形影不离的高莫，成了街头混混，一次被治安警拘留，谁知当晚爆发僵尸狂潮。五人杀出牢房，偶遇一临死军官，军官死前强烈他们一定到15区。五人在外边，还巧遇火辣的埃莉诺、茜瑟。于是，五男两女全副武装后开始无厘搞笑的征程，特别是罗科能与女僵尸嗨休。途中，他们无疑发现瓶装威士忌加上精液，泼洒僵尸身上，然后点燃，能治愈僵尸病毒。军事基地军官获知后，要求他们去有科学家的15区，将此发现告知那些科学家。于是，继续无厘头搞笑的征程……