第三季也发生了各种各样的奇怪事件。科学犯罪对策团队能否用最先进的科学解开并解决这些“禁忌事件”？

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　　讲述野崎修平在之前的事件后升任银行总经理，为了让因为成果主义及裁员而失去士气的银行职员重拾朝气，成为对社会有贡献的银行，他和上作已登场，为人不择手段，已升为常务的立川祥子，及融资部的石原俊之合作进行改革，然而此时前总经理儿子京极春树当上董事，他为了向从父亲手上夺走总经理之的野崎复仇，与祥子一起策动阴谋要让他下台。

香坂（长谷川博己）行动力强，能力突出，被称为“未来的搜查一课课长”。因为一次偶然事件，香坂被贬职到地方警署，失去了出人头地的机会。在分署里，香坂认识了身居低位却拼命解决案件的渡部（安田显），坚定了“正义比出人头地更重要”的信念，决心与黑暗的刑警组织斗争到底。

作家杉本隆治（田村正和 饰）投入极大心血创作的小说《遥远的记忆》得到《金泽每日新闻》文化部长服部（佐野史郎 饰）的盛赞，因此竭力希望作家能延长连载。而为了全身心地创作该作品，杉本专门从东京搬到了金泽。在此期间，居住在东京名叫潮田芳子（广末凉子 饰）致信报社，称因为渴望拜读《遥远的记忆》所以想订阅《金泽每日新闻》。为了证明该读者的存在，杉本的助理（水川麻美 饰）还专门登门拜访，而对方的举止让她颇有些疑惑。未过多久，芳子以小说无聊为由退订报纸。连载正进入高潮，这件事令杉本倍感蹊跷。也许芳子关注的不是小说，而是在那期间发生在金泽的某起事件……