大陈天启年间，负责解决世间玄异、灵怪未解事件、维护百姓安宁的特殊部门“夜行司”，派出拥有昆雷之力的陈凌彻查西域舞姬控物悬浮之谜陈凌和督查扶风发现，操控舞姬的惑心石来自世间异能生物聚集之地“无相城”。“无相城”叛徒木道人假意帮陈凌进入无相城抓捕疑犯，实则利用陈凌打开囚禁自己的屏障，从而前往无相城夺走异能植物日轮花种，企图启用天外飞舟的残余能量繁殖日轮花，让大陈百姓感染日轮花毒癫狂食人，以报大陈皇帝与无相城主灭族之恨。盛开的日轮花被天外飞舟送向皇城，为避免生灵涂炭，陈凌同无相城异能人联手，利用雷电之力将飞舟炸毁。大爆炸毁了日轮花，但也将皇城外十里房屋变成了齑粉，夜行司将此事记载为天启大爆炸。

二十世纪初的中国，民生凋敝。作为没落贵族的金玉蓉立志成为一名救人济世的医生，用自己的双手去帮助更多的人。她遇到了同样心怀苍生的大家族之子赵正南。两人从相识、相知再到相爱。他们也努力地探索着让这个世界变得更好的方式。历经种种磨难，玉蓉终于成为了悬壶救世的医生，赵正南也成为了拥有进步思想，守护一方的军人。但时代的洪流让她们不得不分离，两人最终天各一方。正在玉蓉感到人生幻灭，陷入低谷时，共产主义信仰照进了她的世界，玉蓉渐渐涅槃重生，全身心投入到革命事业中，成为革命的隐形守护者。历经种种险阻后，这对有情人终成眷属。在玉蓉的感召下，赵正南也最终成为红色浪潮的一份子，携手抗日，共同拥抱崭新的中国。