上一部结尾，尼奥（基奴李维斯 饰）终于意识到自己的能力和使命，中弹复活后，变成了无所不能的“救世主”，他和女友崔妮蒂（凯莉·安·摩丝 饰），舰长墨菲斯（劳伦斯·菲什伯恩 饰）回到了人类的基地锡安，受到人们的热烈欢迎。　　此时，“母体”决定先下手为强，派出了两万五千只电子乌贼攻击锡安基地；墨菲斯、尼奥和崔妮蒂则再次进入“母体”，寻找“制钥者”，准备从内部破坏；而本该被尼奥消灭的特勤史密斯似乎出了点问题，脱离了“母体”的控制，拥有可怕的复制能力，阻碍尼奥他们的行动。

尼奥（基努·里维斯 Keanu Reeves 饰）和崔妮蒂（凯瑞-安·莫斯 Carrie-Anne Moss 饰）重回矩阵：在这里，一个是矩阵创造出来，周而复始的日常世界，另一个则是隐藏其后，真实的人类世界。为了弄清楚自己所处的“现实”究竟是真是假，尼奥不得不再次做出选择……

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《副本》讲述的是 300 多年后的一个经新技术改造的社会：意识可以数字化；人体可以互换；死亡不再是永久的。 　　这部复杂而引人入胜的科幻剧情片的第二季讲述了武·科瓦奇（安东尼·麦凯饰）的故事，他是一队星际精英战士中唯一的幸存者，继续自己长达几个世纪的征程，寻找失去的爱人奎尔克里斯特·法尔科纳（蕾妮·伊莉斯·高德斯伯瑞饰）。 经过几十年的行星跳跃和星系搜索，  科瓦奇发现自己被招回了母星哈伦星球，并发誓要找到奎尔。沉溺于过去的他负责调查一系列残忍的谋杀案，科瓦奇震惊地发现这个找出罪犯的新任务和找到奎尔是一回事。在忠诚的人工智能波（克里斯·康纳饰）的帮助下，科瓦奇现在必须与新的盟友合作，智取敌人并找出真相：谁是奎尔克里斯特·法尔科纳？ 　　《副本》第二季的演员阵容包括安东尼·麦凯、蕾妮·伊莉斯·高德斯伯瑞、莱拉·罗兰、克里斯·康纳、迪纳·什瓦比和托本·利布雷希特...

　　After learning that the death of his wife was not an accident, a former CIA Station Chief is forced back into the espionage underworld, teaming up with an adversary to unravel a conspiracy that challenges everything he thought he knew.