人类与怪兽之间的战斗，已是遥远的过去。　　现在是宿有过去的怪兽之魂的少女“怪兽娘”出现的时代。　　成为放晴GIRLS一员的阿基拉、米克拉斯、乌英达姆，　　确实地有所成长，过着充实的每一天。　　某天，传来了新种的“影”引发问题的情报。　　另一方面，GIRLS成员“嘎次星人”，　　感觉到了不可思议的身体变化……

主人公是超级有钱的大家族中的大小姐富士原なえか，她的父母乘坐的飞机突然神秘失踪　　，而なえか只有到了18岁才能取得财产继承权，为了保护直系孙女，なえか的爷爷富士原　　善重郎从他的「女仆王国（其实是忍者王国）」中挑选了两位无论是相貌还是身手都高人　　一等身怀绝技的忍者做なえか的保镖兼照顾生活起居的女仆。这两位忍者，一位是颇有大　　姐姐风范的治愈系女仆，另外一个则是终日套著假面的精壮肌肉男兼心理变态者……。号　　称「为了主人我什么都愿意做」的古怪「女仆」究竟能否保护女主人的安全呢？

虽然犬冢孝士（高桥广树 配音）出生在武术之家，但他本人却是个绝对反对暴力的人士。某一日，一个粉色头发的可爱少女出现在了他的面前，并且自称是他的……未婚妻？原来，少女名叫九头龙桃子（鹿野优以 配音），由于曾经被孝士出手相救过，所以认定了孝士是世间的第一高手，从而许下了要和他生养世上最强孩子的愿望。桃子的热情奔放让孝士防不胜防，但在打闹之间，孝士也开始在意起了这个奇怪的女孩。　　除了桃子之外，外表柔弱内心强悍的中慈马早苗（平野绫 配音），个头矮小却功夫高强的巳屋本色羽（宫崎羽衣 配音）等女孩子们，在一时间居然都以孝士为目标而发起了猛烈攻势。而逐渐的，孝士发现自己貌似被卷入了一场复杂的争斗之中。

　　頂級教室爭奪戰即將開打，召喚獸現身吧！　　「我不要這種教室啦！」──笨蛋明久的喊叫聲響遍校園。這裡就是以嚴格分班制度聞名的文月學園。在A段班教室，有完善的冷暖空調及可調式座椅供優秀的精英們使用；而明久所分配到的放牛班教室裡，只有破舊飯桌跟爛掉的榻榻米。為了心儀已久的元氣少女瑞希，明久慫恿班長雄二展開一場激烈的組別戰爭。一場使用學園開發的試驗召喚獸，爭奪頂級教室使用權的危險賭注就要開始啦！

　　容姿端丽、最强无敌学生会长黑神目泷为你解决问题！　　一年十三组的黑神目泷入选成为箱庭学园第98代学生会长，她在选举战中根据公约设立“意见箱”。　　“你们的梦想是你们自己的所有物，自己挑战就要自己实现，但是，你们的烦恼是我的所有物，一点不剩全部交给我吧！！！”　　于是，黑神和她的青梅竹马“人吉善吉”开始共同解决学生们投递的案件。意见箱人送外号“黑神箱”，获得学生们一致好评，但是……