尼奥（基努·里维斯 Keanu Reeves 饰）和崔妮蒂（凯瑞-安·莫斯 Carrie-Anne Moss 饰）重回矩阵：在这里，一个是矩阵创造出来，周而复始的日常世界，另一个则是隐藏其后，真实的人类世界。为了弄清楚自己所处的“现实”究竟是真是假，尼奥不得不再次做出选择……

该剧时间设定在《刺猬索尼克2》与《刺猬索尼克3》之间，纳克鲁斯（伊德里斯·艾尔巴 Idris Elba 配音）同意收韦德·威波（亚当·佩里 Adam Pally 配音）为徒、并将他训练成真正的针鼹战士。

当电视台宣布她的电视治疗节目将改为小报的震惊节目时，一位古板而又体贴的心理学家回到了家乡并与她的高中恋人重聚。最终，她意识到拥有一个可以分享生活的人比名声或城市的喧嚣更重要。

　　亚里克斯·格纳（盖瑞·丹尼尔斯 饰）是一个普通的中学教师，有一个美满的家庭，但是他却在意外中不幸被一个黑色实验室抓住，用作试验品，在奋力逃出实验室后，又遭遇追捕，成为袭警的罪犯。为了保护自己的生命以及揭露事情的真相，亚里克斯不断逃亡。最终，在记者亨利·汉森的帮助下，这个无辜的中学教师终于洗脱罪名……