赛尔号超级精灵争霸大赛马上就要开始啦！咦？你还不知道？快去问问罗杰船长、贾斯丁站长和雷蒙教官吧！这可是赛尔机器人历史上最伟大的一届精灵争霸赛！所有最具人气的选手都将加入！快看啊，我们最喜欢的赛小息！阿铁打！卡璐璐！曾经拯救赛尔号的英雄小墨！授勋官克罗之子小克！各位精灵训练大师都在整装待发啦！咪咔！雷伊！里奥斯！泰瑞！炎火猴！布鲁……所有最新最强大的火爆精灵悉数登场，点燃你全部的渴望！赛尔号大电影2，精灵争霸赛全面升级！ 　　原本宁静的比格星，天际异火即将降临！浩瀚罗格星系的未知角落，穿越亿万年的神秘力量即将现世！波涛汹涌的异象之下，究竟埋藏着怎样的真相？妄图操纵这股力量的宇宙海盗欧比组织，究竟又将酿造出怎样的惊天大阴谋？到底是谁，来拯救整个宇宙免于这场史无前例的大浩劫？答案只有一个——“赛尔先锋战斗小队！出击！”星际探险员赛小息、阿铁打、卡璐璐来啦！他们...

　　在一张古老而又神秘的地图上，记载了传说中未曾有人见到过的特异精灵，这张地图的现身，在宇宙中掀起了一场腥风血雨。平凡的机械师小墨（杨欧 配音），在误打误撞之中被卷入了宇宙海盗美利图（杨梦露 配音）一手策划的阴谋之中，遭到了对手的俘虏，赛尔号陷入了前所未有的危急情境之中。　　懦弱胆小的播音员乔森（杨海音 配音）、自吹自擂的厨师老汪（刘钦 配音），小墨必须和这些看似非常不靠谱的同伴们结成同盟，对抗强大而邪恶的银河美利图军团，他们的存在，成为了赛尔号的最后一层防卫。最终，平凡的小人物们是否能够凭借着他们的智慧和勇气，打败邪恶，传播正义呢？

民国时期，凤九（祁圣翰饰）师父“鬼手陈”被卷入巨额黄金案，幕后主谋赵千里将其杀害后逃亡。十年后，赵千里（祁圣翰饰）再次现身上海滩，千门后人凤九联合巡捕房吴督察（张晞临饰）、铭辰（高铭辰饰），三位职业老千：熊泰（杜奕衡饰）、李初冬（方楚彤饰）、王天培（摩西饰）。以及秦冬阁（王闯饰）、崔记者（卢卓饰），一起为凤九师父报仇。为引出赵千里，凤九等人层层设局，然而真相也拨开云雾愈渐清晰，一颗被利用的棋子，永远无法看清全局。

清末，太监总管李莲英授意义和团内神打、茅山、术士三坛清除叛徒二舵主雷公（刘家良 饰）。神打坛方少卿（惠英红 饰）与师叔（刘家辉 饰），茅山坛雷勇（刘家荣 饰），术士坛铁猴（小侯 饰）、铁坛主（朱铁和 饰）分头南下广州，寻觅雷公下落。 　　当年雷公掌管云南分舵，因不愿见弟子凭 借所谓“神打”功夫抵抗洋人军火徒然丧命，不惜违背朝廷旨意，将义和团云南分舵解散，化名雨伯隐居乡间。三坛之追杀人马皆有争功之心，暗斗不止。雷勇更用无赖（傅声 饰）乔装雷公以引出真身。方少卿与铁猴先后为雷公大义感动转变阵营，但三坛坛主仍欲置雷公与死地。