以面具反叛者ZERO之身份增强反布里塔尼亚势力·黑色骑士团的鲁路修，与被任命为第3皇女尤菲米娅之骑士的朱雀。各自增强实力的两人，迎来了命运的转机。身为11区副总督的尤菲米娅，宣布了行政特区“日本”的成立。行政特区日本的实现，意味着黑色骑士团存在意义的消失。为了打破这一状况，鲁路修尝试与尤菲米娅会面。为了所要守护之物而做好的觉悟。GEASS的代价。一缕希望与悠久野望一同遭到翻弄，使悲剧逐渐加速——

東京奪還編、開戦。

東京奪還編、開戦。 　　謎の少年?スティグマ率いる“アマラリルク”との戦いを経て少し成長したシャイ。 　　日本に戻ってきた彼女が出会ったのは、忍者の里から家出中という少女?天王寺曖だった。 　　彼女は“アマラリルク”の一員を追って里を出てきたとシャイに告げる。 　　そんな中、東京が突如黒球に包まれて消失する事件が発生。ヒーローたちは東京を救出するため出動するーー。

　　地处新香港市的一个喧嚣夜晚，一度沉缅立体格斗的美剑阳菜(池泽春菜 配音）和夏树、惠美正在巨蛋体育馆观看精彩纷呈的异种格斗，突然之间体育馆内出现剧烈爆炸。阳菜从短暂的昏迷中醒来，发现自己被号称GOMA四天王之一的真红之莎菲亚摄入一个异度空间。危急时刻，冷静沉着的仙蒂·撒哈尼（桑岛法子 配音）出面拯救了她。连番激战过后，阳菜体内蕴含的力量觉醒，实现变身。随后，凤丽华（木村亜希子 配音）也加入战斗中。另一方面，阳菜的父亲随某考古学家探究远古文明的秘密，无意中启动了古文明的动力装置。世界开始面临前所未有的改变……　　本片根据大张正己和青树零梦的原作改编。

特别编“AIR in Summer”于2005年8月28日和9月4日于BS-i放映。 AIR “Summer”编的故事在2005年1月6日的版本中已经包含，“Summer”编动画故事内容长度比游戏的故事短了很多，其中多半是被删减或压缩。由于播出时大受欢迎，而决定推出特别编“AIR in Summer”填补原电视动画版的空间。 　　故事是在原TV版第8话中段开始接轨，加插了大量柳也、神奈和里叶出发去寻找妈妈的旅途中所发生的事情。该OVA包含了游戏Summer篇涵盖所有的内容（Summer篇本身为单线无选择），有认为该部分表现力比之游戏原作更为精彩，为整部动画添色不少。