1991年，香港黑帮三合会会员刘健明（刘德华）听从老大韩琛（曾志伟）的吩咐，加入警察部队成为黑帮卧底，韩琛许诺刘健明会帮其在七年后晋升为见习督察。1992年，警察训练学校优秀学员陈永仁（梁朝伟）被上级要求深入到三合会做卧底，终极目标是成为韩琛身边的红人。2002年，两人都不负重望，也都身背重压，刘健明渐想成为一个真正的好人，陈永仁则盼着尽快回归警察身份。　　重案组从陈永仁手中获悉一批毒品交易情报，锁紧目标人物韩琛，没料情报被刘健明泄出，双方行动均告失败。但此事将双方均有卧底的事实暴露，引发双方高层清除内鬼的决心。命运迥异又相似的刘健明和陈永仁开始在无间道的旅程中接受严峻考验。

江湖大佬洪仁就（刘德华 饰）功成名就，无奈高处不胜寒，手下高佬（曾志伟 饰）等人心怀鬼胎，似乎唯有多年来为其出生入死、情愿肝脑涂地的好兄弟左手（张学友 饰）值得信赖。洪喜得贵子之际，得悉有人买凶取他性命。饱经风雨的洪冷静对待，坐看风起。曾几何时，混在江湖底层的翼仔（余文乐 饰）目睹大哥死状，遂决心以死复仇。好兄弟铁臂（陈冠希 饰）虽患其安危，却仍寸步不离，紧随其后。命中注定的终点，每前进一步都是那样艰难。

重案督察西狗（张晋 饰）与搭档阿德（吴樾 饰）到某渔村追捕涉嫌多桩凶案的歹徒江贵成，却意外发现大量被虐杀的帮派分子尸体和数额惊人的黑市黄金，一场各怀鬼胎的混战因西狗和阿德的闯入变成了整个江湖针对两个警察的困兽之斗，随着调查，西狗发现拥有超高犯罪才智的江贵成竟然嚣张到要借十号风球的天威，谋划跨国掠夺一批价值超过五亿的海底黑金，自己和阿德竟也成了他计划中的棋子，不仅得不到警方支援还被通缉，就在此时，阿德被帮派绑架为人质，贵成已经出海，西狗必须独闯狂风怒海，当狂性被绝境激发，当兽性被贪欲操控，真相和善恶哪个更重？唯有血战八方才能力挽狂澜！

黑帮社会错综复杂，黑帮首脑金度升（米高边 饰）越狱成功，让香港警方更是陷入了高度戒备。更棘手的是，金度升正在实施一套复仇计划，把警方头号通缉犯段边虎劫持并杀害。他的下一个目标，正是段边虎的弟弟段边豹。 　　这个险境环生的黑帮世界，竟然牵连进来了一个善良的女子游静。游静是段边虎的女友，却从来没有想过，自己其实只是一个被利用的人，更因此而卷入金度升的复仇计划。眼看香港即将迎来一场风起云卷的杀机，“猛龙”特警队的一众成员（任达华、吴建豪、余文乐、夏雨、周俊杰、黄圣依等饰）开始了惊心动魄的行动。

故事讲述一位获奖无数的记者彩妮，在追查一宗新闻期间，发现了一个惊天的秘密，一家化学药品公司正在进行一项非常可怕的实验，他们以泰国人作为活体实验对象，寻找一种新型致命病毒的抗体（X计划）。彩妮开始营救无辜被当成白老鼠的受害者，但被该药品公司的年青行政总裁桑(余文乐)发现，桑对彩妮紧追不舍，以图杀人灭口；而来自国家安全局的JATE则要求将已受病毒感染的受害市民全数消灭，以免病毒蔓延全国。彩妮的父亲CORONELNATEE为了女儿的安全，不停劝说她放弃拯救行动，但因妇女之间积怨太深，彩妮对父亲的好意劝说充耳不闻。CORONEL不得已只有请来「THUD」这位顶尖的杀手做彩妮保镖。一项残忍的实验，将彩妮、桑、JATE和THUD都困在局中。国家安全特别支队早已对X计划进入了深入调查，在陈氏实验室将病毒偷运到边境时，早已埋伏好的特别支队将其捕获，缴获病毒，顺利的完成拯救计划。