遥远的未来，地球一度变成冰冻星球。幸存的人类移民外太空，建立了繁荣的殖民星球阿瓦隆，并与外星人成立人类银河联盟。与此同时，名为希迪尔斯的异形肆虐繁殖，与联盟展开旷日持久的战争。在一次针对希迪尔斯母星的战役中，年仅16岁的少尉雷德（石川界人 配音）所在部队遭遇猛烈抵抗。撤退途中，雷德不慎被卷入时空裂缝，与他所驾驶的歼灭兵器钱伯坠落在地球的汪洋中。钱伯被人类打捞到加尔刚蒂亚舰团之上，面对这个与印象中完全不同的人类发源之星，雷德不知所措。在此期间，他和可爱的少女艾米（金元寿子 配音）沟通交流，并成功帮助他们挫败海盗的进攻，赢得地球人的信任。　　由于无法联系到友军，雷德只能暂时留在地球。自幼只知道战斗和服从命令的他，面对这群全无纪律和效率可言的人类，心中最深层的情感慢慢苏醒……

电视动画《健全机斗士》改编自日本漫画家なかま亚咲（本名：名嘉真朝纪）原作的同名漫画。故事主要围绕真玉桥孝一是个外表平凡的高中生，不过他却是个具有HiERo粒子的持有者，而“美容室王子”这个神秘组织为了维护世界和平，免於遭到企鹅帝国的攻击，到处寻找具有该因子的人。该组织成员楚南恭子好不容易找到了他，可是却发现孝一如果要释出HiERo粒子就必须对她做出猥亵动作，后来果真因此打败了来袭的敌人。

在幽暗可怖的冥府之中，有一个相当于警察局的，被称为“十王厅”的神秘机构，除了审判一些罪孽深重的死者外，十王厅还担当了调查人间非正常死亡事件的重要职责。个性开朗平和的青年都筑麻斗（三木真一郎 配音）就供职于此，有着丰富办案经验的他渐渐成为了十王厅的顶梁柱。　　长崎发生了一连串的不思议杀人事件，疑为凶残嗜血的吸血鬼所为。为了调查事件的真相，都筑麻斗和其搭档黑崎密（浅野麻由美 配音）开始了他们危险的旅程。在好友亘理温（关俊彦 配音）和巽真一郎（森川智之 配音）的帮助下，所有线索指向了名为邑辉一贵（速水奖 配音）的变态医师身上。令密没有想到的是，在过去，邑辉一贵和都筑麻斗竟然还有着说不清道不明的纠葛关联，而早已被埋没的，麻斗的过去也渐渐的浮出了水面。

高中生四月一日君寻（福山润 配音），有着异于常人的体质，他可以看到并且吸引各种鬼怪。他身边的好友百目鬼（中井和哉 配音）和小葵（伊藤静 配音）都是特殊能力者，百目鬼有着驱除妖魔的能力，而小葵则有招来厄运的体质。在命运的牵引下，四月一日闯进了壹原侑子（大原沙耶香 配音）的店里，这是一家可以帮人实现任何愿望的店，但是委托人必须付出对等代价。于是四月一日委托侑子帮他远离鬼怪，作为代价，他留在店里打工。随后，他又结识了一个少女灵能力者，五月七日小羽。　　因为长期留在店里打工，四月一日穿越在次元间，接触到各种不思议现象。而在这一季中，四月一日有了更多切身的经历，他更加清晰地看到了自己和身边人之间息息相关的命运。梦境与现实，前世与未来，原来一切都正如侑子所说的——这个世上没有什么偶然，有的只有必然……

西条拓己（吉野裕行 配音）是一个标准的废柴，个性懦弱又不负责任的他住在集装箱里，每日除了上课外都宅在家里玩网络游戏，深深沉迷与二次元世界的他认为一切三次元的都与他无关。此时的涉谷地区，正在发生名为“New Gene”的连续猎奇杀人事件，以被害者死状惨烈而臭名昭著。一日，拓己在网络聊天室里遇见了一名自称将军（代永翼 配音）的神秘人物，将军用津津乐道的口吻预言了下一次的猎奇杀人事件始末，并且传来了血腥暴力的现场照片。　　一开始，拓己只当其是恶作剧者不予理会，但数日后，将军所预言的一切都成为了现实。拓己偷偷潜入犯罪现场，撞见了浑身是血眼神空洞的女生咲畑梨深（喜多村英梨 配音）并认定她就是杀人凶手。但不久之后，梨深却又以昔日老友的身份出现在了拓己面前。凶手究竟是谁？将军的真实面目是什么？在现实与幻想之间，拓己混沌的头脑要做出一次又一次的关乎于性命的选择。