第四次忍界大战结束的两年后，此时此刻的漩涡鸣人（竹内顺子 配音）早已成为盖世英雄一般的人物，无论他走到哪里都受到女孩子和小朋友的喜爱与追捧，他似乎也有其享受这样喧嚣欢闹的氛围。与之相对，壁花小姐日向雏田（水树奈奈 配音）则始终站在角落里，默默注视着这个她喜欢了多年的男孩子。雏田亲手为鸣人织了围巾，怎奈无法鼓足勇气交给对方，喜欢的话语更难以说出口。某个夜晚，雏田的妹妹花火（浅井清己 配音）遭到不明身份之人劫持，带火的陨石则落在附近的山坡之上。为了救回花火，阻止地球毁灭，鸣人、雏田、小樱（中村千绘 配音）、鹿丸（森久保祥太郎 配音）和佐井奉命前去调查舍人（福山润 配音）的真身。在此过程中，鸣人不小心知晓了雏田的心意……

　　春日新（松冈祯丞 配音）是一名平凡的少年，某日，一场意外让他和堂妹春日圣（诹访彩花 配音）一同被卷入了通往异世界的漩涡之中，在混乱中，新和圣失散了。为了找到圣，两人一同回到原来的世界中去，新追寻着种种线索进入了王立书册学院成为了那里的一名转校生。　　性格严谨彬彬有礼的浅见莉莉斯（原由实 配音）、擅长暗杀拥有超强行动力的风间莱维（佐仓绫音 配音）、拥有强大魔力拒人于千里之外的山奈弥勒（日笠阳子 配音）、大大咧咧开朗好爽的不动秋音（柚木凉香 配音）、懵懵懂懂沉默寡言的神无月爱琳（内田彩 配音）、身份神秘特立独行的仓田唯（村川梨衣 配音）和莉瑟罗特（东山奈央 配音），在学院里，等待着新的是七位个性迥异的魔导书使者，在她们的陪伴下，有笑有泪的学院生活就此拉开序幕。

耗日持久的战争结束了，大地虽然满目疮痍，但总算迎来了短暂的平静，一片苍白的静默之中，地球进入了“衰退期”，历史的车轮倒转，整个世界停摆了。童年时代，深空彼方（金元寿子 配音）曾在一片废墟之中邂逅了一位神秘的女子，女子用手中的小号吹奏了《奇异恩典》，被美妙音乐吸引的彼方开始对小号发生了兴趣。　　长大后，彼方加入了军队，被编入1121小队，在那里，她成为了一名通信兵。外表刚强内心柔软的和宫梨旺（小林优 配音）、个性傲娇不会轻易低头的墨埜谷暮羽（喜多村英梨 配音）、冷漠的天才少女寒凪乃绘留（悠木碧 配音）、成熟稳重的费利西娅（远藤绫 配音），在军中，彼方结识了这些个性迥异的好友，充满了快乐的日常就此展开。

家族……被我拒绝的地方： Clannad的男主角——冈崎朋也，是一个拒绝与家人交流、不愿留在家里的人。在他幼年时，母亲因故去世……父亲因此整日借酒消愁，原本应该相依为命的两人，却因为不愿去理解对方的痛苦而互相疏远，生活渐渐颓废下来；最终在他初中时，因为一次家庭暴力，而使得父子俩的关系落到了谷底。从此以后，朋也与父亲行同陌路，两人的关系似乎只能在血缘和法律上得以维持。他每天去上学，但无论是上课还是课余都只是魂不守舍地发呆，终日得过且过地继续着学生生涯。他不参加任何社团活动，也没有深交的朋友，连唯一能和他亲密说话、每晚“收留”他的“朋友”——春原阳平，也无法触及到他心中冰冻的部分……互不乾涉对方深藏的心底的痛苦，这是保证他们两人能继续同来同往的底线。岁月无情地流逝，那在朋也身边仿佛停滞了的时间，也即将迎来终结……就在那长长的坡道之下

　　向水日菜子（川荣李奈 配音）是一位冲浪爱好者，对大海有着强烈的热情和真挚的喜爱，只有在风口浪尖处，她才能够感受到自己真正的在活着，可是别看日菜子在海上神气活现，在生活里，她其实是一个多思多虑的女孩，对未来感到深深的迷惘。　　一场活在让日菜子结识了名为雏罂粟港（片寄凉太 配音）的消防员，勇敢正直的港很快就吸引了日菜子的注意，两人一拍即合走到了一起，开始了一段充满了幸福的恋情。可是好景不长，一场海难夺走了港的生命，日菜子无法接受竟然是自己挚爱的大海夺走了她最爱的人。某日，陷入消沉许久的日菜子哼起了两人在一起时经常会唱的那首歌，令她没有想到的是，港竟然出现在了自己的面前。