普通的上班族藤木户健二，他的妻子在忍者斗争中丧命。在他濒死之际，竟然被神祕的忍者灵魂附身了！捡回一命的藤木户，从此成为“忍者终结者”，专门终结忍者，为了复仇而战！以近未来都市新埼玉为舞台，忍者杀手VS忍者的生死决斗揭开序幕.....

战国时代──以恐怖来统治天下最凶最恶的武将“牙鬼幻月”。由“伊贺崎家”率领的一群忍者，经过激烈的战斗，打倒了“牙鬼幻月”。 但“牙鬼幻月”却留下了不详的预言… “444年后，我将变成妖怪复活再次以恐怖支配天下！”时光流逝—— 终结忍者“伊贺崎好天”跟复活的妖怪“牙鬼幻月”决斗，并成功将它封印。时光再次流逝到了现代──“牙鬼幻月”的封印被解除， “牙鬼幻月”的怨念生出了一批妖怪，这些妖怪们组成“牙鬼军团”， 为了让“牙鬼幻月”完全复活，妖怪们到处搜集人们的恐惧心，开始向人们展开袭击！紧急时刻，出现了5个年轻人。 他们正是伊贺崎家的末裔，也就是终结忍者・伊贺崎好天的孙子们！“当忍则忍，可不忍则不忍！” 三代同堂，用火热的“忍者心”（Nintality）以及各种异想天开的忍术来漂亮的击退妖怪！为了继承祖父的“终结忍者”这个封号，也为了阻止妖怪军团让“牙鬼幻月”复活， 他们不仅不忍，还要大肆反击！

阴守护（私市淳 配音）出身于历史悠久的忍者世家，外表看起来呆头呆脑的他自然也继承了流传在家族血液之中的忍术。阴守护家世世代代都肩负着保护绀若家的责任，而阴守护要保护的，是绀若家的大小姐绀若优奈（中原麻衣 配音）。实际上，阴守护一直都非常真挚的喜欢着优奈，可是，家族传统让他只能够将这份心意深深的埋藏在心底。　　阴守护和优奈就读于同一所学校之中，在这里，他们结识了很多有趣的朋友们——含着金汤匙出生的千金大小姐沢菓爱里（新谷良子 配音）、一心想要杀掉优奈但渐渐被阴守护所吸引的剑客真双津椿（小岛幸子 配音），会有怎样好玩的故事发生在这里呢？

信长深爱的妹妹·市，嫁给了浅井长政。　　而浅井·朝仓军与织田军的冲突已经不可避免。　　只要有一瞬的迷惘就会失去重要事物的大规模野战“姊川之战”，含泪的千鸟于此战觉醒。　　名为天下布武的不合常理的征程！　　不得不将自己的妹夫打倒！！　　本格时代剧搞笑动画，姊川·石山篇 突入！！