故事发生在明朝初年，原啸天（黄少祺 饰）同擎天剑派掌门宋凌霄之女吟荷（阮丹宁 饰）两情相悦，即将成婚。大弟子易水寒（高曙光 饰）妒忌原啸天所得，勾结云妃（贾妮 饰）及企图反明复元的韩林儿等人，寻找当年丢失的四块麒麟玉，想要取代宋凌霄的掌门之位。　　易水寒设计使得原啸天一家人背负上了勾结外族意图谋反之冤罪，原啸天的双亲命丧黄泉，原啸天则被投入深牢大狱之中。在狱中，原啸天结识了四方门门主东方青木（千叶真一 饰），在他的帮助之下成功越狱。与此同时，易水寒投毒加害宋凌霄，并欺骗吟荷原啸天系真正凶手，单纯的吟荷相信了易水寒的谎言，在其蛊惑之下成为了他的妻子。得知原啸天越狱的消息，易水寒苦练霹雳掌，只为了能将其除之而后快。

民国时期，关中名医金郎中，因受诬陷下药不当将剿匪司令何雷鸣妻子致死，被逼全家跪行为何妻送葬。金郎中为洗血耻，带大儿子金治国和土匪田川挖掘何家祖坟，意外得到珍贵的秘方。金郎中顿生恶意，将田川埋在坟中，但却将其子收养。金治国无生育能力，为了家族的兴盛，金郎中强迫二儿子金保国与大儿媳荷花同房，生下一子。土匪为报杀父之仇抢夺了何家刚刚出生的龙凤胎，两个孩子一个落入匪巢，一个流落金家。从此，荷花暗藏着对小叔……

　　二十一集电视系列剧《命案十三宗》取材于近几年发生的十三宗真实命案，经改编创作而成，主要情节与人物都是真实的。摄制组对这十三宗命案的凶犯做了三十多个小时的电视采访记录，并将这些采访作为一个部分放在剧中，与故事情节有机地结合成一个完整的影片。　　他们都说肯定不想杀人，但又承认自己后来确实杀了人，那是怎样的过程？是什么因素造成了惨剧的发生呢？他们绝非成心作恶之人，使他们走到这一步的就是人类所共有的人性弱点，自私、嫉妒、无知、狭隘、愚昧……断送了他们原本平静幸福的生活。被他们杀害的人痛苦地死去了，他们还活着，却没有了快乐。　　我们可能也曾面临过困境、也曾受到过伤害和由此产生的反抗，那种维护尊严的欲望和这些杀人者都是相同的，甚至更强烈。但有所不同的是，他们都采取了一种错误的方式。企图摆脱那种困境，却不料将自己置身于一个根本无法挽回的绝境，剥夺了给自己造成困境的人的生命，成了一名杀人犯。于是他们成了故事中的人。

故事发生在公元204年，曹操（李进荣 饰）父子四人与许禇（李泽晓 饰）起兵攻打邺城，眼看后宫不保，袁母让年轻的嫔妃逃跑，自己则要保节寻死。袁绍（于子宽 饰）兵败后，曹操入城，曹丕（张迪 饰）对被迫献舞的甄宓（李依晓 饰）一见倾心，面对儿子骄奢淫逸，曹操甚是恼怒，将其子发配边关。甄宓为保贞节自缢被曹植（杨洋 饰）救下，两人日久生情不表。得胜回朝的曹丕对甄宓念念不忘，甄宓以曹丕放弃与三弟争夺世子之位为条件，否则不嫁于他。不明就里的曹植以为甄宓变心，暗自伤情，得到甄宓的曹丕违背诺言，簒得魏王之位，甄宓痛恨曹丕的背信弃义，拒不领受曹丕的封后御旨......

清乾隆初年，黄马褂应贡试占鳌头，殿试应对得体，乾隆很是欣赏，可是不懂为官之术的黄马褂为了吏治的事与皇上争辩，乾隆意给这个狂徒一点教训，于是只点了他二榜榜眼，未授一官半职，发回原籍历练。暗中皇上却派一等带刀侍卫唐敬之点化黄马褂，并将孟娇钦点给他。　　黄马褂来到扬州，扬州县令冯记德，爱贤如渴，聘他担任县学训导，教育地方子弟。娇娇辗转来到扬州，冯县令亲自为两人主婚。　　扬州知府因参与贩私盐下狱，冯记德接任，黄马褂成了候补知县。黄马褂上任后，整日忙着了解民情，运用与众不同的方式，幽默、机智地解决了百姓困难。唐敬之也总会及时出现指点迷津，令黄马褂敬佩不已。　　黄马褂不黯官场习惯，说话耿直，幸好冯记德一旁维护，娇娇加以点化，黄马褂进步很快，县令当的得心应手。娇娇总是不放心，疑神疑鬼，跟踪！为此引发误会不断，令黄马褂哭笑不得。　　黄马褂的人格品质和做官为民思想，得到乾隆皇帝赏识，乾隆御赐金匾“好官”！点黄马褂为扬州知府，并赐了一件“黄马褂”……