故事开端为第一季故事的七年之后。　　高达模型对战的规则被革新，亦令其对战更受欢迎。　　虽然伊织诚和岭司得到第7回敢达模型对战世界大赛的冠军，也令学校圣凤学园沾光不少。不过，其“高达模型对战部”就只剩下部长—国中部3年级学生·星野文奈一人。　　在新比赛规则底下，如果要参加比赛必须以3人1组的参与战斗。而圣凤学园高达模型对战部郤因为人数不足的情况下难以出场。　　在偶然的之间，出现了一名转校生，就是跟随师傅修行多年次元霸王流拳法的神木世界。之后，被称为天才高达模型创制家的高坂祐马也加入。　　终于，星野文奈、神木世界、高坂祐马三人组成了Team·Try·fighters，能够在高达模型对战大赛中登场，向世界大赛展开挑战。

并非此处的世界，并非此时的时代。　　被称作将军的执政者们所治理的草原与沙漠的国度·土耳基将国。　　12年前，在与邻国·巴尔特兰帝国之间的战争中失去母亲的玛法姆特，　　期盼着和平的国家，而成为了土耳基史上最年轻的将军。　　但，随着土耳基因交易获得巨万财富而取回了安宁，帝国的侵略再度开始了。　　与搭档犬鹫·伊斯卡达尔一起，为了粉碎席卷国家之间的阴谋与策略而行动的玛法姆特，　　究竟要如何将自己的祖国导向和平？　　——在理想与现实的夹缝中，他所采取的行动是……

在一次机缘巧合之下，和妹妹天奈（三泽纱千香 配音） 相依为命的杰（铃木达央 配音）穿越到了100年后的世界，杰震惊的发现，100后的他们曾经的宅邸，变成了一所学校。就这样，杰隐姓埋名改名为神宫司高马，开始在学校中一边学习，一边寻找回到过去世界的方法。　　在学校里，杰很快就结识了一帮好友。以自我为中心，谁也不放在眼里的大少爷藤代悠希（KENN 配音）、拥有可爱外表，并常常利用自己的可爱来操纵他人的青叶萤（永冢拓马 配音）、智商和人气都很高，但始终不会以真心待人的绯樱春人（丰永利行 配音）、拥有着和福尔摩斯一样的好奇心的茶野京一（小林千晃 配音）。

　　矢代个性超M又变态的人，从不会让别人看透他的内心。某天身边来了一名叫做百目鬼力的随从兼保镖。虽然早早就下定决心，绝不对不会对部下出手，但矢代不知为何，被百目鬼所深深吸引。彼此怀抱着自己的伤痛而活着的两人，他们的故事即将开始。

国江田计（阿部敦 配音）是拥有着极高人气的国民级主播，他拥有英俊的外表和温柔的个性，总是以无懈可击的完美形象出现在大众面前。可实际上，国江田计拥有一颗非常腹黑的内心，他从来都瞧不上那些拜倒在自己脚下的粉丝们，认为他们都是没有脑子的愚民。　　一天，身着便服邋邋遢遢的国江田计不小心撞到了正在骑自行车的男子，之后才发现原来这个人正是自己从前采访过的动画作者都筑潮（川原庆久 配音），幸运的是，都筑潮并没有认出国江田计的身份。因为受伤，都筑潮无法完成工作，协助他的任务自然落到了始作俑者国江田计的头上。