此版《源氏物语 千年之谜》由鹤桥康夫执导，不仅使用CG，还加入动作场面和科幻效果，制作费用高达十亿多日元(折合人民币7千8百多万)，于2011年12月10日在日本全国公映。 　　影片把原著作者紫式部(中谷美纪 饰)身处的平安时期与光源氏（生田斗真 饰）所在天下相交错，两条线 索并行。一个空间中紫式部受藤原道长（东山纪之 饰）任命开始创作《源氏物语》，并与藤原道长发生了爱情牵绊。另一个空间是紫式部创作出的光源氏与藤壶女御（真木阳子 饰）、六条御息所（田中丽奈 饰）、夕颜（芦名星 饰）等众多女性的爱情纠葛。在关闭的创作进程中，紫式部现出了灵魂出窍的状态，与笔下对光源氏陷入苦恋而化为生灵的六条御息所的灵魂重叠。阴阳师安倍晴明（洼冢洋介 饰）发现了这个情况，开始追踪生灵……

日本，幕府时代，流浪中的瞽女（抚琴卖艺的盲人女子）市（绫濑遥饰）在大雪中被人收留，收留她的男子心怀不轨，不想市一剑就将其刺伤。原来市深怀绝世剑法，流浪四方，目的是寻找一名男性盲人剑客。 　　市在途中与貌似胆小的落魄剑客十马（大泽隆夫饰）相识，二人结伴来到了一个村镇。这里有名为万鬼党的流氓团伙作恶，市轻易杀掉几个恶人，但十马却被当地人误会为英雄，十马被当地人为保镖。万鬼党的复仇随之而来，小镇面临一场腥风血雨。市与十马不仅要拯救大家的性命，还从万鬼党中得知了一直寻找的剑客的消息。

在俱乐部Honey Bunny担任雇佣店长的清原修造（藤原龙也 饰）赌马时弄丢店里的营业额，为免被老板破魔翔（窪塚洋介 饰）杀死，他被俱乐部头牌茉莉亚（中岛美嘉 饰）拉去向恐怖魔女涉柿多见子（池畑慎之介☆ 饰）举债。拆东墙补西墙的做法无济于事，修造找来最信赖自己的小弟小 岛一德（田中圣 饰）和生意濒临破产的常客金森健（小杉龙一 饰），策划了抢劫银行的行动。抢劫当天，三人事成后回到Honey Bunny，可是分赃不均产生内讧。而在这次银行劫案背后，又有多方势力以及阴谋介入其中。尔虞我诈，坑蒙拐骗，谁也不知结局将会如何…… 　　本片根据木下半太的小说原作改编。

故事发生在某知名企业，以收到的一封电子邮件拉开序幕。这封电子邮件将会从根本上威胁到企业的生存，好不容易才查出了警视厅公安部的一个警部与这家企业有着密切的关系，但是，特别监察官却企图竭力隐藏可供查明真相的线索。为了调查案件真相而被提拔的，是即将被革职查办的白州胜彦(椎名桔平饰)和秋吉宗贵(窪塚洋介饰)二人。　　专门调查警察组织内部犯罪的特别监察官室，对某个危险人物进行了调查。他就是警视厅公安部警部的石卷修次。由于他与大型胶片制造商——DAITO公司相勾结，并且与中国黑社会组织的关系等等，一直令人怀疑，说不定哪天就会引发足以导致警察机构崩溃的爆炸性新闻。　　为了掌握石卷的动向，警察厅特别监察官室长——御代田警视正，决定起用二个将被革职查办的警探对警察组织内部进行调查。这两个警探就是白州胜彦和秋吉宗贵。白州胜彦——在毒品交易现场射杀嫌疑犯后，拿走作为证据的现金。秋吉宗贵——有女装癖，在警视厅盗窃女警制服。　　与此同时，DAITO公司本部收到了一封奇怪的电子邮件恐吓信，送信者署名“溺水的鱼”。电子邮件上宣称：如果不能满足信里的要求，不但DAITO公司本部，就连其设在东京都内的DPE照相馆也将受到毁灭性的打击。虽然这样的要求让人感到不可思议，但是这种威胁根本无法判断其真伪。DAITO的四个照相馆的显影液箱里都被掺入了漂白剂，顾客的胶卷也因此全部报废了。罪犯的手段虽然周到、完善，但又不同于一般的恐吓企业犯罪。“溺水的鱼”的目标并非是金钱，而是指名要求DAITO公司的管理层高级职员，到来往行人众多的地方，自己进行有损自己尊严的行为。鉴于这些高级职员们的爱社精神，他们不得不流着泪、可怜兮兮地在众人面前一个个地活活丢丑……　　某个星期五的夜晚，石卷在富有才气的图像艺术家——冈部哲晃所经营的俱乐部举办的特色娱乐活动“同性恋之夜”上露面了。为了潜入调查，不太情愿的白州和略显几分兴奋的秋吉假扮成一对同性恋情侣，混进了这个狂热而令人窒息的俱乐部……　　意外的悬念一个接一个地明朗化了，白天展开了激烈的枪战，白州和秋吉潜入了混杂着各种人物、各种欲望的大都市黑社会组织中，在他们面前发生了令人震撼的事件……

在7年前在煤矿深处发现了不明身份的怪物的乡下小镇，疫病的传言流传开来，在心脏病患者新增的过程中，修验道者的年轻人贤一失踪了。贤一是活生生的木乃伊，为了拯救这个世界而进行的终极修行，就变成了神佛。然后，贤一醒过来说：“祓除被妖怪附身的世界。”