「候鸟e人」的故事主轴，围绕着一群关心候鸟生态的年轻人，描写一段从舄湖湿地展开的浪漫爱情，「候鸟e人」的情节就像不同季节候鸟的飞翔路径，从七股到关渡，从马祖无人小岛来到时尚现代的台北街头。小青、邵韩和湘子，三个频率接近，彼此互为同伴。却不得不在讲求唯一的爱情里，面对着得到与市区的角色。鸟人和黑琵在网路里相遇，也在现实生活里交会。邵韩和小青在到七股赏鸟的途中，两人因擦撞而结识。彼此剑拔弩张，邵韩的好友小汪同时也爱上了小青。等到两人终于在现实世界中相识，爱情与友情的取舍，该如何是好！而邵韩以为死去的初恋女友湘子，其实还在人世，过往的真情、愧疚与责任，新欢与旧爱之间的挣扎，更令他手足无措。至情至性的他，该如何抉择？偷偷爱着小汪的丁丁，痴痴守候着丁丁的小谢，又会发展出怎样的情节？

故事的起源在一所超级白金学院，它是四大家族为培养优秀后代而创立的，因此身为四大家族之后的F4(言承旭饰演道明寺、周渝民饰演花泽类、朱孝天饰演西门、吴建豪饰演美作)在学校里的地位便可想得知，从幼稚园、国小、高中一直到大学，学校里没有人敢反抗F4这四个霸气的大男生，直到她的出现，捣乱了这看似控制得宜的局面。她——牧野杉菜(徐熙媛饰演)一介平凡女子，带着父母(董至成饰演杉菜爸爸、王月饰演杉菜妈妈)要她飞上枝头变凤凰的梦想来到这里，在好友李真(叶安婷饰演)不小心恼怒了F4为首的道明寺，并引发杉　　菜为友情出头，从此展开了她与F4之间的爱恨情仇。　　F4逼人退学的红条子不出所料地贴在杉菜身上，同学们如鸟兽窜地离她而去，连好友李真也躲在一旁不敢出声，这个学校真的没有王法了，杉菜努力打工赚买来的机车，不是爆胎，就是被解体，垃圾不待在垃圾桶里却倒在杉菜头上，朋友不互相帮助却企图强暴她，杉菜终于受不了了，她要抵抗，她要给猪头四教训，她要他们红条，谁怕谁啊。　　而杉菜的勇气跟坚毅实在有别于其他女孩，道明寺看在眼底，似乎动了凡心，他要人挟持杉菜到家里，给她作最棒的护肤课程、发型设计、服装供给，目的就是要杉菜臣服在他之下，谁知道如杂草般的杉菜根本不吃这一套，道明寺气极了。　　道明寺的刻意接近杉菜引起了学校喜欢道明寺女孩的严重醋意，她们决定好好羞辱一下杉菜，于是假意邀请她参加牛仔舞会，谁知道当杉菜到达之时，才发现是个陷阱，这根本不是牛仔舞会，这是高级宴会啊，大家都穿得好正式，百合(贝儿饰演)千会(张若蓁饰演)这两个假意是好友的同学根本就不安好心存心让杉菜出糗，没关系，杂草般的杉菜会作出反击的。　　虽然在宴会里无法整到杉菜，百合、千会决定拿出花泽类心仪的对象藤堂静(钱韦杉饰演)来打击杉菜，因为他们知道杉菜似乎有那么一点喜欢F4一员的花泽类，而这样的反击真的成功了，藤堂静的回国的确带给杉菜相当的冲击，再加上她亲眼目睹花泽类在藤堂静的海报前失神的样子，杉菜真的不知道该怎么办，而这个时候花泽类竟然吻了她……

蒋小花（杨丞琳 饰）是个乐观自信，打扮夸张却自认为很入时的女孩，开着一家叫做小花饰品店的门头店。意外的机会认识了追求完美，苛刻严谨的出名时尚大师唐门（潘玮柏 饰）。两人从一开始就互看对方不顺眼，争吵不断。蒋小花的小学同学贾思乐（藤冈靛 饰）从日本留学回来，原本记忆里受人欺凌的小胖子变身成了多金帅气的富家少爷。小花为了吸引贾思乐的关注，不得已寻求死对头唐门的帮助，开始了一系列的打造计划。殊不知，贾思乐从小就暗自倾心于保护照顾自己的蒋小花，对小花展开了追求。贾思乐的母亲为了帮自己心中唯一的标准儿媳江蜜（陈妍希 饰）巩固地位，不惜请求唐门来追求蒋小花。而出乎人意料的是，原本是死对头的蒋小花和唐门，在吵闹的生活相处中早已爱上了彼此…

本该是无忧无虑的年纪，童嘉蒂（杨丞琳 饰）和小南（陈希妍 饰）这对患难姐妹却无心悠闲度日。家里欠了大笔债款，需要她们无时无刻提醒自己要赚钱。于是四处打工，做各类兼职成了嘉蒂和小南的日常活动。这一天她们接下了霍氏百货爱心园游会义卖摊位，而这次稀疏平常的打工却改变了嘉蒂之前一成不变的生活。她偶遇了霍氏俩兄弟霍彦（王传一 饰）和霍达（贺军翔 饰）。他们一个斯文有礼，一个痞气十足，像是冰与火的两端。而嘉蒂本以为与二兄弟的接触仅此一次而已，结果没有想到不久又迎来了下次见面。嘉蒂二十岁生日的时候，小南替嘉蒂许下第三个愿望：向走过的第十个男生要电话号码。在二人紧张的期盼下，经过的第十个男生居然就是霍氏两兄弟。而嘉蒂阴差阳错的拿到了霍彦的号码，似乎新的故事即将展开……　　一边是整日打工还债的现代灰姑娘，一边是性格各异，但都是有钱人的大少爷，嘉蒂该如何抉择呢？

齐悦一直暗恋着篮球队队长源伊，终于在姊妹淘的鼓励下决定告白，谁知告白时因为紧张过度，错把情书交给了大一的新生──江猛，也开始了她挥之不去的恶梦。　　齐悦因为出糗仓皇逃离现场，没有发现重要的情书遗失，江猛也以此要胁要齐悦成为他的「仆人」，齐悦成了江猛的小跟班，平时上课要帮江猛抄笔记之外，只要有任何需要，齐悦都必须完成主人的任何要求。源伊温柔的鼓励下，齐悦终于下定决心要彻底摆脱恶魔江猛的纠缠。谁知道，齐悦的情书居然被公布在布告栏上！羞愤的齐悦不顾一切的杀去找江猛算帐，江猛却表示自己从没有得不到的东西。看着江猛的眼神，不安渐渐袭上齐悦心头……　　在齐悦诸事不顺的同时，齐悦的母亲雪薇找到了属于她的真命天子，而这个齐悦未来的父亲不是别人，正是江猛的父亲兼学校理事长江友晖！更糟糕的是，在江猛天使笑容的「欺骗」下，他成了篮球社的一员，而齐悦，成了篮球社经理……