1990年代，云南边陲。“祭鬼节”吸引了大量少数民族同胞聚集，女警员小娟（王茜 饰）正与毒贩王德山（杨和平 饰）夫妇交易，卧底铁峰（申军谊 饰）趁机抓获这对贩毒夫妻。突审中王妻阿琼（王妮 饰）被杀手灭口，铁峰押王德山来到交货地点，不料遭冲锋枪伏击。王德山主动要求带铁峰化装成毒贩去境外寻找毒枭，当见到毒枭罗毅夫（孙淳 饰），铁峰大惊，原来此人是他从小一起长大的玩伴。罗对铁峰的身份心存疑虑，他要对其进行考察。入境后铁峰与小娟假扮夫妻，并未露出破绽，但狡猾的罗毅夫利用绑架其女儿文华（宋扬黎 饰）再次试探铁峰。铁峰为救文华再次出境，巧遇罗的情妇英多与罗发生火并，交战中铁峰救下已负伤的罗毅夫，面对救命恩人，罗向铁提供了一份贩毒人员名单......

重案Ⅵ组成员包括曾克强（李成儒 饰）、季洁（王茜 饰）、江汉（董勇 饰）、白羚（高榕 饰）和黄涛（张林 饰），前三位在破案一线工作多年，后两位刚跨出警校大门。他们在局长（张潮）指示下，侦破了一起起凶杀、爆炸、投毒、绑架、抢劫、截肢……案件。但神勇冷面下，五人亦有柔情和心事。 　　曾克强某次侦案 时因迟来一步令队友被杀，发誓要抓到凶手却总不能如愿；季洁要与男友踏上红地毯前夕，发现他与妹妹有染；白羚和黄涛的侦案知识多来源于书本，实战经验的缺乏常令他们拖整队的后腿……而五人也因性情不一常有矛盾产生。但有案要侦时，五人又总能迅速调整状态，将缉凶视作第一。

本剧被称为中国版《急诊室的故事》。由《重案六组》原班人马出演，这一次警察们都变成了医生。而女主角王茜日前在接受记者采访时表示，因为在医院看多了生死，她都打算息影了。

公平律师事务所开业接到的第一个大案就是永盛大业公司老总马永盛之子马尚明与林静离婚案。辛平作为林静的代理人与马永盛展开了激烈的较量。马使出浑身解数，要夺走林静对儿子的抚养权，并暗中计划将“公平律师事务所”彻底搞垮。所有阴谋均被辛平逐一破解，此时一个隐藏多年的秘密大白于天下。原来二十年前，马永盛和马尚明的生父曾经是经营伙伴，后因永兴小区开发中的严重污染问题发生争执，分道扬镳。马尚明生父被马永盛搞垮，被迫自杀。为了掩人耳目，马永盛将马尚明收为养子，并将女儿嫁给他。关键时刻林静以污染事件要挟，与马永盛达成协议，反过来阻挠辛平对污染事件进行深入调查。最后辛平克服种种困难，终于使受害居民得到应有赔偿。马永盛在家中凄然死去，林静在辛平鼓励下开始新的生活。

　　南方某省公安厅的秘密询问处，女督察杨华以及督察处处长史杰正在进行司法询问，对指控汉山市刑警支队长龙达"性侵犯"的案件进行调查。　　在汉山市警方的缉毒过程中，线人赵东携带20公斤毒品神秘失踪，主管这次行动的龙达因此背负重大责任事故的罪名。此时又有检举龙达贪污受贿的举报信送来，省厅决定委任杨华去调查龙达的问题，并且对曾被检举有重大问题的汉山市仁昌集团进行秘密调查。在杨华找到与仁昌集团有关的证人宋大福进行询问时，宋却突然身亡。龙达被暂时羁押，执行"双规"。龙达接到赵东"砖窑、生命危险"的寻呼，无奈之下打倒看守他的史杰，逃出警局。　　龙达来到赵东求救的砖窑，并没有发现赵东，而且再次陷入杀人的重大嫌疑。市局决定内部通缉龙达。龙达感到自己陷入别人的阴谋，便去找指控他"性侵犯"的柳思思，企图从中获取一些消息，而此时的柳思思则被冷野云追杀，龙达搭救并胁持柳思思，开始逃亡。　　在龙达的追问下，柳思思撒谎说是因为钱的关系而被迫诬陷龙达，龙达准备把她交给马玉，为自己辩白。在龙达与马玉进行交涉的场所周围，被史杰布下了狙击手，以防龙达反抗，龙达愤而逃走。杨华发现史杰一直在与线人进行秘密接触，加之此次史杰的行动，杨华开始怀疑史杰，认为史杰与龙达有重大关系，企图杀人灭口。龙达接到赵东的传呼：我危险、小木屋..