该剧以位于地方城市的石垣医院为背景，讲述怪胎天才医生金师傅和热情高涨的年轻医生们之间的故事。由第一季的刘仁植导演、姜银庆编剧再次合作。

该剧改编自星零的小说《帝皇书》。 　　一身正气、心系苍生的梓元（迪丽热巴 饰）原为开国元勋之后，因家族突遭变故流落民间。不愿被命运扼住喉咙的她取名任安乐，决定尽自己所能来安置因战争受难的黎民百姓，期待能为百姓创造一个太平的家园，同时她也在调查了解真相，希望能还家族以清白。她在帮助百姓的过程中不仅获得了一定的威望和赞誉，同时也被太子韩烨（龚俊 饰）赏识，成为其幕僚。随后，在足智多谋的任安乐协助下，韩烨连破科举舞弊案、江南赈灾粮贪污案。此时边境爆发战争，以天下苍生为己任的任安乐决定跟随韩烨出征，期望尽早结束战争以换来百姓的安居乐业。面对敌强我弱的情况，任安乐运筹帷幄，带病杀敌，赢得险胜，百姓也迎来了和平的曙光。最终，韩烨帮助任安乐查明了当年之事，为家族洗清了冤屈。

“刘记酒铺”历经风雨，迎来百年店庆。刘家孙女刘采凡主持拍摄店庆宣传片，意外与走失多年的刘家亲女儿张涵雁相遇。为保住自己在刘家的地位，采凡想尽办法阻止涵雁认祖归宗。当年，涵雁走失被田英收留，恰巧田英是采凡的生母。原来，田英生下采凡后，怕整日酗酒的丈夫张武带走采凡抵债，便把她送人。涵雁半工半读与田英相依为命，生活艰难却积极乐观。涵雁的身份揭晓回到刘家后，备受宠爱，与张易南的感情更加稳定。而采凡却因自己的过错被赶出刘家，她一时妒火攻心，选择与涵雁同归于尽，却自食恶果，身受重残。涵雁摒弃前嫌，悉心照料采凡，所有人为涵雁的举止感动，刘劲成和汤慧敏夫妇更是欣赏女儿的情怀，重新接纳采凡。家和万事兴，“刘家酒铺”迎来更加兴隆的百年。

1960年代末期，千百万北京、上海等大城市的红卫兵和老三届响应毛主席“知识青年到农村去，接受贫下中农的再教育，很有必要”的号召，奔赴全国各地农村生产建设兵团，谱写了一曲曲动人的青春之歌。在黑龙江生产建设兵团，涌现出赵天亮（唐曾 饰）、周萍（傅晶 饰）等一大批建设边疆、保卫边疆的有志青年。在陕北、山东屯涌现出赵曙光（程皓枫 饰）、冯晓兰（李欣凌 饰）、许蕾（周娟 饰）等志愿献身农村的知识青年，在城市家中，他（她）们大多是父母眼里的长不大的孩子，可是在边疆、在农村，他们成长为真正的战士，也有部分青年永远长眠在了那片土地上......

1955年，国际局势风云变幻，新中国的建设迫在眉睫，身处他乡的中国知识分子中掀起了一股归国热潮。留美物理学教授钟培林，留苏深造的王怀民、何吟薇夫妇和黄凯华等物理人才克服重重阻力，辗转踏上报国之路。1958年中国的第一个核武器研究机构A所成立，王怀民与战争英雄陶志纲、护士杨佳蓉以及彭雄飞、黄凯华、钟心等科学家一同加入A所开始了原子弹研发工作。他们在研发过程中渡过了研发条件艰苦、自然灾害等重重危机。终于在1964年10月16日成功试爆了中国首颗原子弹。大家欢腾雀跃，又一鼓作气地投入到氢弹和两弹结合的研究中去，不久，这两项伟大的事业也相继取得了胜利。王怀民和杨佳蓉，陶志纲和钟心也终于在同一天迈入了婚姻的殿堂。1978年，科学的春天终于到来，王怀民却因积劳成疾将不久于世。医院里，他用尽力气，在民用核电报告的扉页上写下了他们几个人的名字。