乍看之下，宫本蕾贝卡（斋藤千和 配音）是一个满头金发的11岁少女，她的外表可爱个性胆小，是个人见人爱的小不点。令人想不到的是，蕾贝卡居然是毕业于麻省理工大学的天才少女，并且，她还有着一份正式的职业——桃月学院一年C班的班主任。面对着这个娇小的班主任，一年C班的同学们发出了不可置信的呼声。然而随着接触的深入，他们发现，这个外表萝莉的老师，却有着一颗正直勇敢的心。　　在桃月学院里出没着各式各样有趣的家伙， C班的神秘老头子（大竹宏 配音），D班的酒鬼五十岚美幸（大原沙耶香 配音），B班的早乙女（花轮英司 配音），再加上每个班级里鬼灵精怪的同学们，蕾贝卡快乐的校园生活开始了。

在参拜母亲坟墓的回程途中，真嗣（绪方惠美 配音）和葛城美里（三石琴乃 配音）遭遇了第七使徒的攻击，关键时刻2号机势如破竹挫败对手，真嗣也由此结识了2号机的操纵者式波·明日香·兰格蕾（宫村优子 配音）。与沉默寡言的绫波丽（林原惠美 配音）不同，明日香自信张扬，甚至有些自大，在和真嗣相处的日子里，彼此闹出不少的笑话。他们三人分别驾驶着零号机、初号机和2号机，抵抗了第八使徒猛烈的攻击，在这一过程中，淡淡的情愫悄然在这三个青年男女的心中萌生。不久后，第九、十使徒相继降临，真嗣他们面临着生与死的残酷考验…… 　　本片为福音战士新剧场版四部曲第二部。

映像特典　　DVD BD各卷收录的原创故事，共4话，每话5分钟。　　DVD BD卷数特典话数日本副标题TVB中文标题发售日　　第1卷2.5话はっぱの水族館落叶水族馆2011年10月28日　　第2卷3.5 话サンタさんへ给圣诞老人2011年11月25日　　第3卷6.5话おそらにまんかい满天飘樱2011年12月16日　　第4卷8.5话かえり道归途2012年1月27日

　　因为拥有能够看到妖精的特殊体质，少女莉迪雅（水树奈奈 配音）常常遭到同伴们的排挤和孤立，但是即便如此，莉迪雅依旧决定利用自己的能力，成为一个专门处理人类和妖精之间事宜的妖精博士。某一日，在渡轮上，莉迪雅遇见了一位神秘的金发青年——爱德格（绿川光 配音）。爱德格自称青骑士伯爵，并且请求莉迪雅帮助他寻找其遗失的，能够证明身份的宝剑。就这样，莉迪雅同爱德格签订了契约，一同踏上了寻宝的旅程。　　城市里发生了臭名昭著的强盗事件，被通缉的犯人无论怎么看都很像身边来路不明的爱德格，而那个跟随在爱德格身边不离不弃的少年随从雷温（杉田智和 配音），也越发的形迹可疑起来。爱德格真的是伯爵吗？他又隐藏了怎样不可为人道的身世呢？逐渐的，莉迪雅发现自己正在接近事件的真相。

童年时期的一个盛夏，女孩子面码（茅野爱衣 配音）死于意外。这件突如其来的死亡事件，深深刺痛了她的五个儿时玩伴——仁太、安鸣、雪集、鹤见子以及波波。六人组成的秘密基地“超和平Busters”就此解散，活着的五人带着无法弥补的创伤各自疏远各自长大。十年后，面码居然以一种只有仁太能看见的形式，带着一个想要实现的愿望回来了。