本片讲述了香港新界围村陆氏家族在房产开发交易黑幕后的故事。故事开始于村民罗永就（古天乐饰）醉酒撞死了异姓兄弟陆永远（钱嘉乐饰），陆永远之妻月华（周迅饰）从此与他势不两立。罗永就5年后出狱，发现陆氏家族大家长陆瀚涛（曾江饰）和其女陆永瑜（叶璇饰），以及女婿（黄磊饰）已经坐拥新界最大房产公司，而陆家兄弟陆金强（刘青云饰）、陆永富（方中信饰）等人则疯狂扩张势力。不久香港房产巨鳄邀请罗永就“共商大事”。同时，神秘人阿祖（吴彦祖饰）透露给月华一个通过窃听得到的秘密消息，他告诉月华要想在这场欺天阴谋中复仇，就必须按照他的指示去做……于是几方势力都开始暗自行动。本片是《窃听风云》系列的第三部，但是除了“窃听”这一核心创意外，故事内容与前两部无关。

　　利比亚恐怖分子到港刺杀来港开会的美国政要,香港警方派出雷勇领导的特工队侦查此案，目的是消灭此批恐怖分子。由于此案交政治部负责，令到重案组高级督察许达明感到不满，暗中插手调查此案。他误交了以女记者身份掩护的恐怖分子首领Catherine，被她杀害了。特工队队员陈志成的表妹Stella亦卷入这案的漩涡中，被恐怖分子所杀。特工队经过慎密调查和计划，在恐怖分子企图刺杀来港开会的政时出动……

　　1991年，悍匪叶欢一伙打劫多家金店，其火力凶猛，警方始终不能将其绳之以法。三年后，卧底警察黑猫（刘青云 饰）与叶欢手下沙皮（林保怡 饰）一同出狱，黑猫靠做代客泊车度日，不久黑猫因出色的驾驶技术被沙皮引荐给叶欢，受邀在他们下一次的抢劫中担任司机。虽然黑猫将叶欢的犯罪计划通知警方，不料在行劫过程中，黑猫被警方击伤，但幸运躲过了叶欢的怀疑。因黑猫的上司在追捕中身亡，他失去了警方的信任，为了挽回局面，黑猫孤注一掷抓捕沙皮，却将他误杀。警方由此将黑猫列为通缉犯，面对警方和叶欢两方的怀疑，黑猫举步维艰证明自己的清白……

钟国强（张国荣饰）是名教堂的神父，某日妓女白雪花（袁咏仪饰）逃债至告解室，白雪花在底层挣扎的悲惨命运打动了神父，他决定开始挽救这群迷途羔羊的肉体和灵bbb。r同时，和白雪花的夜总会挂钩的黑帮老大“恐龙”成为警方的目标，警察大哥（刘青云饰）和手下（陈锦鸿饰）打算将白雪花设为突破点，开始了对其一行人长时期的盯梢。r白雪花等人在神父的悉心引导下渐渐回归正途，她们找了新工作，还开始组乐团唱歌……欣慰的神父悄悄地重返教堂，却不知随后白雪花又被迫回到“娱乐界”。神父再次出山，联手警方开展了一场营救行动！

年轻神父洪中遇上避债逃入教堂求救的妓女白雪花为拯救这迷途羔羊，洪乔装迁入妓女分租的单位，CID刘青发为追查卖淫集团跟踪白。洪为众妓女找新工作，培养她们的音乐兴趣，更为她们与黑社会评理，发锲而不舍的追查，引起误会重重。