混沌初开，世界分成东西二星，隔空向往，在龙之御使的守护下发展出迥异的文明。正值战国乱世的东之星，尾张傻瓜织田信长（宫野真守 配音）和属下明智光秀（樱井孝宏 配音）、丰臣秀吉（梶裕贵 配音）目睹了武田家强大战铠的惊人威力，内心受到极大触动。与此同时，西之星的美丽少女贞德·辉夜（日笠阳子 配音）因为能够听到天启，而被人们看作是恶魔附体的人。某天她遇见天才发明家列奥纳多·达芬奇（杉田智和 配音），达芬奇偷偷开走竹取号，带着贞德和最新研发的战铠“奥世铠”来到东之星。信长意外启动了西之星人无法操控的奥士铠，他俨然成为了传说中的救星王。他为贞德取名兰丸，这个女子从此成为愚者信长生命中最重要的存在。　　战国乱世，东之星和西之星的乱战也即将拉开序幕……

天野こずえによる人気コミック「ARIA」のアニメシリーズ10周年を記念して製作された完全新作アニメーション。水の惑星アクアを代表する観光都市ネオ・ヴェネツィアを舞台に、街をゴンドラで案内するウンディーネとして働く水無灯里と仲間たちの日々を描く。過去のテレビシリーズやOVAでアニメ化されていない原作の2エピソード「その 逢いたかったあなたに…」「その 暖かなさよならは…」と、原作者・天野の描き下ろした漫画をもとにしたオリジナルストーリー「その 遙かなる未来へ…」の3つのエピソードで構成される。監督は佐藤順一、脚本は吉田玲子とテレビシリーズのスタッフが再結集。

一名戴面具的男子自昏迷中醒来，回忆一片空白，然而眼前所见到的，却是长着耳朵和尾巴的怪异女子。原来女子名叫艾露露（柚木凉香 配音）。艾露露告诉男子，她是“亚人类”，她和她同族的同伴们住在远离城市的深山之中，靠种植和农耕过着朴素的生活。族长将哈克奥罗（小山力也 配音）的名字赐予男子，从此，哈克奥罗便在这宁静的山村里过上了平静的生活。村子里住着一群善良快乐的人们，哈克奥罗运用自己的智慧帮助村民们开垦耕种，极快的提高了粮食的产量，同时在村民中也有了很高的威望。　　当村民们正为了这个丰收年而举族欢庆的时候，野心勃勃的藩主将贪婪的目光投向了他们。藩主克扣粮食又增加赋税，让本来就清贫的村民们不堪重负。终于，在忍无可忍之中，村民们爆发了，而带领起义军英勇战斗的不是别人，正是哈克奥罗本人。他们能推翻腐朽的统治吗？哈克奥罗的真实身份究竟是谁？这一切都在战争的推进中得到了解答。

乍看之下，宫本蕾贝卡（斋藤千和 配音）是一个满头金发的11岁少女，她的外表可爱个性胆小，是个人见人爱的小不点。令人想不到的是，蕾贝卡居然是毕业于麻省理工大学的天才少女，并且，她还有着一份正式的职业——桃月学院一年C班的班主任。面对着这个娇小的班主任，一年C班的同学们发出了不可置信的呼声。然而随着接触的深入，他们发现，这个外表萝莉的老师，却有着一颗正直勇敢的心。　　在桃月学院里出没着各式各样有趣的家伙， C班的神秘老头子（大竹宏 配音），D班的酒鬼五十岚美幸（大原沙耶香 配音），B班的早乙女（花轮英司 配音），再加上每个班级里鬼灵精怪的同学们，蕾贝卡快乐的校园生活开始了。

在参拜母亲坟墓的回程途中，真嗣（绪方惠美 配音）和葛城美里（三石琴乃 配音）遭遇了第七使徒的攻击，关键时刻2号机势如破竹挫败对手，真嗣也由此结识了2号机的操纵者式波·明日香·兰格蕾（宫村优子 配音）。与沉默寡言的绫波丽（林原惠美 配音）不同，明日香自信张扬，甚至有些自大，在和真嗣相处的日子里，彼此闹出不少的笑话。他们三人分别驾驶着零号机、初号机和2号机，抵抗了第八使徒猛烈的攻击，在这一过程中，淡淡的情愫悄然在这三个青年男女的心中萌生。不久后，第九、十使徒相继降临，真嗣他们面临着生与死的残酷考验…… 　　本片为福音战士新剧场版四部曲第二部。