以即将废部的男子中学软式网球部为舞台，讲述了抱着各自想法的少年们讴歌青春的故事。

2020年，网络对于如今人们的生活而言已经是不可或缺的一部分。但是，人类所不知道的是，在网络的另一面有着一个无限的世界——数码世界，以及居住在其中的数码兽……以首都圈为中心发生了大规模网络故障，乱闪的信号灯、乱码的室外屏幕……新闻上报道是网络恐怖袭击。故事的主人公是住在东京近郊高层公寓的小学五年级生八神太一。为了准备周末的夏令营而一个人留在家中，去涩谷的母亲和妹妹八神光乘上了一辆无法停止的电车。为了救母亲和妹妹，太一急忙赶往涩谷，当他前往车站月台的瞬间发生了不可思议的现象，太一去了数码世界！孩子们与搭档数码兽相遇，一同面对未知的“冒险”！

　　自己的阳台栏杆上出现了像被单一样挂在上面的少女，这种非现实的情节出现在了上条当麻的眼前。虽然在这个城市——最先进科学引导的学院都市中，超能力已经可以通过科学技术创造出来，但是眼前这位自称“茵蒂克丝”的少女还是把上条当麻吓了一条。茵蒂克丝自称因拥有十万三千本魔导书而被魔法师追杀，而上条当麻靠自己的超能力也认定了少女的魔法。少女以危险为由离开上条家，上条如往日一般去学校学习，但放学回家，却发现茵蒂克丝倒在血泊之中。在科学与魔术交叉的世界中，上条当麻与茵蒂克丝的故事开始了。

　　死神武器职业专门学校，简称“死武专”。其学生分为“工匠”与“武器”。　　据称，收集99个鬼神的灵魂与1个魔女的灵魂，“武器”就会进化成最强的死神武器“DEATH SCYTHE”　　以最强的“工匠”为目标的镰刀“工匠”玛嘉与其“武器”SOUL二人，开始了艰辛的试炼。有同样目标的还有暗器“工匠”BLACK STAR与“武器”务椿，和死神之子——死神•德•基德与他的武器双枪姐妹。　　三组少男少女成长的故事，伴随着的是“死武专”的危机四伏。神秘的魔女美杜莎心怀鬼胎；死神大人不离开“死武专”寸步，似乎也是为了隐藏天大的秘密。

出生于坦克世家的高中少女西住美穗（渕上舞 配音），早已厌烦了被作为传统文化在世界范围内普及、号称修炼女性的“战车道”。为了逃避这个恼人的宿命，美穗特意转学至没有这一科目的大洗，并结交了渴望浪漫爱情的武部沙织（茅野爱衣 配音）和擅长花道的五十铃华（尾崎真实 配音）两位好友。谁知日本即将举行战车道大赛，美穗所在的大戏女子学园也顺应恢复了战车道的科目。由于相关经验学院短缺，在学生会长强迫之下，美穗和两位朋友一同选修战车道。对于这门停滞已久的学科，18名少女们寻找废弃战车、维修护理、进修操作和作战课程、实战演习……，如此等等，一切都从头开始。 　　经过一段时间的艰苦磨练，大洗女子学园的少女们驾驶着神采奕奕的战车，开向了高手如云的全国大赛会场……