- 蓬莱岛,相传为古时候的神之岛,秦始皇曾派徐福及三千童男童女寻找蓬莱,以觅长生不老之方。岛上生活着人类、妖怪和半妖,他们和睦相处,自由自在。为了防止半妖受到伤害,巫女奏使用法术使蓬莱岛隐藏起来,每隔50年才会伴着浓雾出现一次。然而邪恶的四斗神趁小岛结界虚弱之际潜入,污染鸣动之窑,对岛上居民进行无情统治和屠杀。在戈薇到达战国时代的50年前,犬夜叉曾和桔梗乘船登上蓬莱,结果遭遇四斗神。在交战中,犬夜叉的力量被四斗神封印。 50年后,蓬莱岛再次出现。半妖阿蓝趁机逃出,遭到四斗神一路追杀,最后幸被犬夜叉一行救下。为了拯救岛上居民,犬夜叉、戈薇等人决定踏入蓬莱。另一方面,阿蓝的姐姐浅葱决定跳入窑中保全兄弟姐妹们的性命……
- 元军攻打日本之际,中国大陆的妖怪为了得到死者魂魄亦东渡日本。在这里,他们遭遇了犬夜叉的父亲斗牙王。经过一番艰苦鏖战,大陆妖怪最终被封印在斗牙王的牙齿中。 时间回到战国时代,四魂之玉的一枚碎片飞到不归之森,唤醒了大陆妖怪首领之子玛瑙丸。为了解开被斗牙王牙齿所封印的力量,玛瑙丸派随从琉璃、玻璃将犬夜叉一行人引到不归之森,并诱使犬夜叉用铁碎牙斩断结界。结界消失,被封印上百年的力量开始复活,玛瑙丸变得愈加强大。与此同时,玻璃和琉璃分别夺去了珊瑚的云母和法师的风穴,使犬夜叉一方陷入苦战;另一方面,戈薇的意识被玛瑙丸控制,她迫不得已用箭再次将犬夜叉封印,之后更被桔梗推入枯井,穿越时空回到了现代……