《小医生》是依据迪特里希·格吕纳麦耶教授（Dietrich Gr?nemeyer）的同名儿童读物改编，讲述了小医生的探险之旅。纳诺姐弟自幼失去父母，是爷爷奶奶带他们长大。爷爷山迪是园艺工人，在斯诺特教授实验室工作。斯诺特教授运用剽窃的缩微技术，可以将机器人缩小到纳米级别，植入人体后可以控制人类大脑。他借为山迪医治腰伤机会，将机器人植入山迪体内。恰好被来找爷爷的纳诺撞见......纳诺的同学莉莉请求纳诺帮忙复习生物课，他们发现爷爷行为怪异......

　　齐什（约克·亚赫罗 Jouko Ahola 饰）是出生在一个犹太家庭中的平凡的男孩，成年后，他只身一人前往大都市谋生，进入了一家夜间剧场工作。剧场的老板豪森（蒂姆·罗斯 Tim Roth 饰）是一名投机分子，他敏感的察觉到了政局的变化，预感到纳粹份子的蠢蠢欲动，于是开始在剧场里安排上演一些赞美纳粹和描绘纳粹统治下未来图景的剧目，深得德国人的欢迎。　　之后，豪森更是将齐什包装成为了日耳曼的民族英雄齐格弗里德，这让齐什从默默无闻的小演员一跃成为了德国人心目中的巨星。随着齐什名气的逐渐增大，他的犹太人的出身更加不可被暴露，与此同时，谄媚逢迎的生活让他倍感厌倦。

　　故事发生在1943年的柏林，纳粹对犹太人的屠杀已经接近了尾声。最后一批生活在德国的犹太人被赶上了开往集中营的火车，拥挤狭窄的车厢中没有任何食物，这最后的六百多名犹太人，他们的结局似乎只有两个——死在火车上，或是死在集中营里。　　亨瑞（哥德昂·布克哈德 Gedeon Burkhard 饰）和他的太太露丝（西贝尔·凯基莉 Sibel Kekilli 饰）以及他们的两个孩子也在其中，巨大的压力和痛苦之中，露丝亲手杀死了自己的孩子。珠宝修理员艾伯特（Roman Roth 饰）和老板的女儿相恋已久，他们决定只要能够活着走下火车，就举行结婚仪式。时间一分一秒的前进着，火车离最后的死亡终点站越来越近。